最早被栽培的咖啡樹源自衣索比亞，而這個原始品種——鐵比卡（Typica）——至今仍廣泛種植。如今已存在許多其他品種，有些是自然突變，有些則是雜交的結果。部分品種有自己明確的風味特性，其他則取決於風土（terroir）、栽培方式與採後處理。
很少咖啡消費者知道阿拉比卡有不同品種，主因是世界大部分咖啡向來以「產地」交易。一批咖啡可能來自許多農場，到了出口時，已無人知道貢獻的生產者各自種了哪些品種，只知道它來自世界哪個區域。這正開始改變，但我們對「品種對風味影響有多大」其實所知仍少。
以下品種描述不會列出具體風味註記，除非確有明確而獨特之處。影響杯中品質的因素太多，加上缺乏有組織的研究，妄下風味斷言會造成誤導。
名詞辨析：variety、varietal 與 cultivar
「variety（品種）」與「varietal」常被混淆。
- Variety（品種）：單一物種（此處為 Coffea arabica）在基因上彼此不同的變異，可能在樹形、葉片或果實上展現不同特性。「cultivar（栽培種）」也是可接受的用詞，即「cultivated variety」的縮寫。
- Varietal：應用於指稱某品種的「具體實例」。例如談某座農場的產出時，說它是「100% Bourbon varietal」才正確。
奠基品種#
- 鐵比卡（Typica）：被視為所有品種突變或選育的源頭。荷蘭人最早將咖啡傳播至世界各地進行商業生產，帶的正是此品種。果實多為紅色，杯中品質優異，但產量相對較低。仍廣植於世界各地，因而有 criollo、sumatra、arabigo 等多個別名。
- 波旁（Bourbon）：鐵比卡在留尼旺島（Réunion，當時稱 Bourbon）上的自然突變。產量高於鐵比卡，精品業界多認為它有獨特的甜味而備受珍視。果實有紅、黃、偶有橙色。過去廣泛種植，但在許多產國被更高產的品種取代——當時市場尚未成熟到願以足夠高價補償其較低產量。
- 卡杜拉（Caturra）：波旁的突變，1937 年於巴西發現。產量相對高，但有「超載結果（overbearing）」而枝條枯死（die-back）的傾向，良好的農場管理可避免。在哥倫比亞與中美洲特別受歡迎。有紅、黃兩種，屬矮株品種，因易於手採而受青睞。
- 藝伎／給夏（Geisha / Gesha）：Gesha 是衣索比亞西部一個城鎮；此品種由哥斯大黎加引入巴拿馬，但被認為源自衣索比亞。以「異常芳香／花香」的杯感著稱。
藝伎自 2004 年起爆紅：巴拿馬翡翠莊園（Hacienda La Esmeralda）以一支藝伎參賽，風味之獨特罕見，在拍賣會喊出每磅 21 美元的高價。此紀錄在 2006、2007 年被打破，達到每磅 130 美元——幾近商業級咖啡的百倍。這也鼓勵了中南美洲許多生產者改種此品種。
更多品種：突變、雜交與抗病選育
Mundo Novo：鐵比卡與波旁的自然雜交，1940 年代於巴西發現並以發現地命名。因產量高、強健、抗病，且能在巴西常見的 1,000–1,200 公尺海拔表現良好而受種植。
Catuai：卡杜拉與 Mundo Novo 的雜交，由巴西 Instituto Agronomico do Campinas 於 1950–60 年代育成，結合卡杜拉的矮株特性與 Mundo Novo 的產量與強健。有紅、黃兩種。
Maragogype：鐵比卡的突變，最早發現於巴西。豆粒異常碩大，常被稱為「象豆（Elephant Bean）」；葉片亦極大但產量相對低，果實熟時轉紅。
SL-28：1930 年代由肯亞 Scott Laboratories 從一支坦尚尼亞抗旱品種選育而成，如今備受珍視。果熟轉紅，豆粒明顯偏大，能產生明確的果味（常被形容為黑醋栗）。頗易感染葉鏽病，在較高海拔表現更佳。
SL-34：選自 French Mission Bourbon（自留尼旺帶回非洲的波旁品種），先見於坦尚尼亞、後至肯亞。同樣能有明確果味，但杯中品質一般被認為不及 SL-28。也易感葉鏽病，果熟轉紅。
Pacas：波旁的自然突變，1949 年由薩爾瓦多 Pacas 家族發現。果實紅、矮株易採，杯感近似波旁而受歡迎。
Villa Sarchi：以哥斯大黎加發現地命名，亦為波旁的自然突變、具矮性。正被用於育成極高產量，且能有優異杯感，果熟轉紅。
Pacamara：Pacas 與 Maragogype 的雜交，1958 年育成於薩爾瓦多。葉片、果實、豆粒皆極大；杯中特性鮮明，可如巧克力與水果，但也可能出現令人不悅的草本、洋蔥味。果熟轉紅。
Kent：以 1920 年代在印度參與選育計畫的一位種植者命名，為抗葉鏽病而育成，但可能被新菌株擊垮。
S795：同樣育成於印度，為 Kent 與抗鏽老品種 S288 的雜交。在印度與印尼廣泛種植，但如今被認為已喪失大部分抗病力。
野生阿拉比卡品種#
上述品種在基因上其實極為相似，因為都源自鐵比卡這單一品種。然而衣索比亞種植的許多咖啡樹並非選育的栽培種，而是原生的地方品種（heirloom），很可能來自不同物種與不同品種間的雜交。迄今對這些野生品種的基因多樣性與杯中品質，所做的編目與探索仍極少。